Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms