Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b2Q3UJB0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms