Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod2Q3UHZ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod2Q3UHZ5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms