Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms