Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms