Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms