Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rnf180Q3U827 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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