Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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