Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms