Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KhsrpQ3U0V1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms