Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc136Q3TVA9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms