Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxw18Q3TSA9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms