Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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