Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms