Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms