Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms