Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms