Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam178bQ24JP3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms