Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms