Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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