Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms