Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms