Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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VgfQ0VGU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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VgfQ0VGU4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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VgfQ0VGU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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VgfQ0VGU4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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VgfQ0VGU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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VgfQ0VGU4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms