Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col19a1Q0VF58 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms