Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms