Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Cntnap5cQ0V8T7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cntnap5cQ0V8T7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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