Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cnn2Q08093 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cnn2Q08093 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cnn2Q08093 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnn2Q08093 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnn2Q08093 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnn2Q08093 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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