Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MestQ07646 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MestQ07646 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MestQ07646 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MestQ07646 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MestQ07646 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MestQ07646 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MestQ07646 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms