Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms