Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdx4Q07424 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms