Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfe2Q07279 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms