Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms