Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Caprin2Q05A80 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Caprin2Q05A80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Caprin2Q05A80 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Caprin2Q05A80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms