Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoc2Q05020 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms