Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox13Q04891 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox13Q04891 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms