Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms