Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms