Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms