Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms