Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms