Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms