Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms