Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms