Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms