Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfiaQ02780 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms