Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms