Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms