Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Yy1Q00899 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Yy1Q00899 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms