Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax8Q00288 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms