Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cry1P97784 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cry1P97784 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cry1P97784 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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